Uyku, vücudun sadece dinlenmesini sağlamakla kalmayıp aynı zamanda pek çok fizyolojik süreci de düzenleyen kritik bir mekanizmadır. Güncel bilimsel çalışmalar, uyku bozuklukları ile bağırsaklarda yaşayan mikroorganizmaların dengesi arasında karşılıklı bir ilişki olabileceğine işaret ediyor. Özellikle uyku yetersizliğinin, bağırsak florasındaki bakteri çeşitliliğini ve bileşimini doğrudan etkileyebileceği üzerinde duruluyor.
Sindirim süreçleri ve bağırsak hareketleri, vücudun biyolojik saatiyle uyumlu bir şekilde çalışır. Bu nedenle düzensiz uyku saatleri, biyolojik ritimle ilişkili olan sindirim işlevlerini olumsuz yönde etkileyebilmektedir. Öte yandan, bağırsak bariyerinin işlevi ile uyku yoksunluğu arasındaki ilişki de araştırmacıların odak noktasında yer alıyor. Bağırsak bariyeri, zararlı maddelerin geçişini engelleyerek besin emilimini düzenlerken, uykusuzluğun bu bariyer üzerindeki etkileri henüz kesin bir sonuca bağlanmış değildir. Konuyla ilgili bilimsel araştırmalar halen devam etmektedir.