Avrupa futbolunun kulüpler düzeyindeki en önemli organizasyonu olan UEFA Şampiyonlar Ligi'nde Fenerbahçe, uzun süredir devam eden bir hasretle karşı karşıya. Sarı-lacivertli camia, en son 2008-2009 sezonunda lig aşamasında yer aldığı bu turnuvaya yeniden dahil olabilmek için yıllardır çeşitli eleme turlarında ter döküyor.
İstanbul temsilcisi, tarihinde toplam 6 kez katıldığı bu dev organizasyonda en büyük başarısını 2007-2008 sezonunda Arthur Zico yönetiminde çeyrek finale yükselerek yakaladı. Ancak o tarihten sonra kulüp, turnuvanın grup aşamasına ulaşmakta zorluklar yaşadı. Fenerbahçe, elemeler sürecinde daha önce 11 kez hedefine ulaşamadan organizasyonun dışında kaldı.
Kulübün Avrupa macerası, saha sonuçlarının yanı sıra idari süreçlerden de etkilendi. 2011-2012 sezonunda direkt katılım hakkı elde edilmesine rağmen şike soruşturması nedeniyle Avrupa'ya gidilemedi. Ayrıca 2013-2014 sezonu sonrasında UEFA tarafından verilen iki yıllık men cezası, takımın şampiyonluklarına rağmen turnuvada yer almasını engelledi.
Geçmiş yıllarda Feyenoord, Dinamo Kiev, Young Boys, Spartak Moskova, Arsenal, Shakhtar Donetsk, Monaco, Benfica ve Lugano gibi farklı rakiplerle eleme turlarında karşılaşan Fenerbahçe, bu eşleşmelerin birçoğunda istediği sonucu alamadı. Özellikle Jose Mourinho yönetiminde girilen son dönemlerde de play-off ve eleme aşamalarında yaşanan elenmeler, sarı-lacivertlilerin Şampiyonlar Ligi özlemini dindirmesine engel oldu.
Fenerbahçe, Şampiyonlar Ligi'nde çıktığı toplam 40 müsabakada 11 galibiyet ve 6 beraberlik alırken, 23 maçtan mağlubiyetle ayrıldı. Sarı-lacivertli ekip, 1996-1997 sezonunda ilk kez adım attığı bu arenada yeniden boy gösterebilmek için çalışmalarını sürdürüyor.